В сентябре 1954 года на базе кафедры Политэкономии Уфимского нефтяного института была создана самостоятельная кафедра «Экономика, организация и планирование нефтяной промышленности», в задачу которой входило преподавание дисциплин по экономике, организации и планированию деятельности буровых, нефтегазодобывающих и нефтеперерабатывающих предприятий на трех технических факультетах: горном, технологическом и нефтемеханическом.
В конце 50-х годов предприятия начинают испытывать потребность в высококвалифицированных инженерах-экономистах, способных решать сложные социально-экономические задачи и на этой основе обеспечивать повышение эффективности производства, поэтому в 1960 году на базе кафедры началась подготовка инженеров–экономистов по специальности «Экономика и организация нефтяной и газовой промышленностью». Через 5 лет в 1965 году состоялся первый выпуск инженеров экономистов по данной специальности.
Первым заведующим кафедрой был кандидат экономических наук В.А. Бугров. С 1961 г. кафедру возглавлял профессор В.Е. Тищенко.
В июне 1973 года была проведена реорганизация кафедры с образованием на ее основе двух выпускающих кафедр: кафедры экономики, организации и планирования нефтяной и газовой промышленности (ЭНГП) и кафедры экономики, организации и планирования нефтеперерабатывающей и нефтехимической промышленности (ЭНХП), созданной на базе лаборатории технико-экономических исследований Министерства нефтеперерабатывающей и нефтехимической промышленности СССР. Возглавил кафедру ЭНХП профессор Ю.М. Малышев.
В последующем кафедрой ЭНХП руководили: профессор А.Ф. Брюгеман (1973-1978 гг.), доцент З.А. Хакимов (1978-1981 гг.), доцент В.М. Гермаш (1981-1986 гг.), профессор Ю.М. Малышев (1986-2005 гг.), доцент В.Д. Земцова (2005-2006 гг.), профессор Е.В. Евтушенко (2006-2007 гг.).

Кафедру ЭНГП возглавляли: профессор В.Ф. Шматов (1983-1989 гг.), профессор В.Г. Карпов (1989-2003 гг.), доцент Н.Р. Поздеева (2003-2007 гг.).

В 1981 году на базе кафедры «Экономика и управление на предприятии нефтеперерабатывающей и нефтехимической промышленности» была образована предметная комиссия «Экономика строительства», которую возглавил профессор Д.Ф. Бронштейн.

В 1997 году на базе предметной комиссии по приказу ректора УГНТУ профессора А.М. Шаммазова для организации подготовки и выпуска экономистов-менеджеров по специальности «Экономика и управление на предприятии строительства» была создана кафедра «Организация и экономика в строительстве». Возглавлял кафедру до 2007 года профессор О.Л. Денисов.
В 2007 году три кафедры: «Экономика и управление на предприятии нефтяной и газовой промышленности», «Экономика и управление на предприятии нефтеперерабатывающей и нефтехимической промышленности», «Организация и экономика в строительстве» были объединены в одну кафедру «Экономика и управление на предприятии нефтяной и газовой промышленности», которую возглавил профессор Е.В. Евтушенко.

В 2012-2013 гг. кафедру «Экономика и управление на предприятии нефтяной и газовой промышленности» возглавлял к.э.н., доцент А.М. Фаттахов.

В 2013-2015 гг. кафедру «Экономика и управление на предприятии нефтяной и газовой промышленности» возглавляла д.э.н., профессор Т.Б. Лейберт.

С марта 2015 года заведующим кафедрой «Экономика и управление на предприятии нефтяной и газовой промышленности» является д.э.н., профессор И.В. Буренина.